广州地铁7号线二期一共12地铁站，分别为大学城南站、深井站、长洲站、洪圣沙站、裕丰围站、大沙东站、姬堂站、加庄站、科丰路站、萝岗站、水西站、燕山站。
路线从大学城南站东端引出，下穿华南理工大学、广州中医药大学后，沿中环东路、广中医路、金洲南路行走，在深井村南侧设置深井站与穗莞深琶洲支线大学城东站换乘；线路沿金洲北路敷设，在下庄村前设长洲站与规划八号线东延线换乘；其后线路穿越大片农用地及下穿珠江，在洪圣沙站货场内设洪圣沙站；线路向东北斜穿珠江，下穿黄埔港后进入丰乐南路，在金逸雅居小区前设裕丰围站与十三号线换乘；出站后继续向北敷设，之后折向东北，穿越地块后，在镇东路与大沙地东路交叉口北侧设大沙东站与五号线换乘；线路其后向北延伸，下穿广九铁路后折向西北进入丰乐北路，在姬堂路与丰乐北路交叉口处设姬堂站与规划十九号线换乘，站后接出入场线；之后沿科丰路行走，在南云五路和科丰路交叉口设加庄站；出站后线路继续向北敷设，在科丰路与开泰大道交叉口处设科丰路站，之后线路下穿地块折向东北进入开达路，在香雪三路与开创大道交叉口北侧，广州国际体育演艺中心前设萝岗站与六号线换乘，线路继续向北，在水西保障房地块内设水西站与二十一号线换乘，出站后转向西北，在二十一号线水西停车场旁边设终点站燕山站。
广州地铁7号线二期一共12地铁站，分别为大学城南站、深井站、长洲站、洪圣沙站、裕丰围站、大沙东站、姬堂站、加庄站、科丰路站、萝岗站、水西站、燕山站。
